此时，《航海世纪》开展了网络游戏史上规模最庞大、新颖独特的海陆两栖攻城战，战争场面体现不再是目前网络游戏中存在的一个、二个公会在同样的场景上进行没有探讨性的战争。整个过程及系统皆充满了惊奇趣味，和现实中的战争一样，《航海世纪》的战争，同样讲究天时、地利、人和。

从公海到近海再到登陆战争，从攻击方到防守方，双方展开的更多的是斗智斗勇。

公海迎接战，防守方以备战者的姿态迎击对方的攻击，可以提前布置战斗阵型迎击进攻者；

港口防守战，守城方在港口依靠防守的优势：防守方的炮台和守卫船NPC，进行防御阻击战；

城堡坚守战：城堡的坚守是防守方的最后阵型。公开战争、进行战争失败的军队可暂避于城堡港口码头，组织最后的阵地坚守战。

在整个战场系统中，影响每次战役因素都会根据场景的不同都会有相应的变化，每个场景的战争因为不同战术因素、不同场景影响，参加战斗不同的公会成员因素，最终影响战争的结果。天时（公海战场海浪的大小影响着攻击的视野、风向的方向不同影响着船只的转变方向等）、地利（港口防守方的炮台和守卫船NPC）、人和（海战和陆战的技能、装备、不同战术）让整个战争设计变得更有可玩性和探讨性。

胜利方最终以血与火焰为证，争夺着荣耀，争夺着王权的证明，并赢得至高荣誉象征――港口控制权。获得港口控制权以后。